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新方法可以提供更好的干細胞制作方法
點擊次數(shù):1262 更新時間:2019-07-08

斯克里普斯研究所(TSRI)的科學家們發(fā)現(xiàn)了一種將普通成體細胞“重編程”成干細胞的新方法。

在一項發(fā)表在Nature Biotechnology的在線論文中的研究中,TSRI科學家篩選了一個包含1億個抗體的文庫,發(fā)現(xiàn)了幾個可以幫助將成熟的皮膚樣細胞重新編程為干細胞(稱為誘導多能干細胞(IPSCs))。

從更成熟類型的細胞制備IPSCs通常涉及將四種轉錄因子基因插入到那些細胞的DNA中??茖W家鑒定的抗體可應用于成熟細胞 - 它們與細胞表面的蛋白質結合 - 作為三種標準轉錄因子基因插入的替代物。

研究作者,TSRI部門副教授Kristin Baldwin說:“這一結果表明,終我們可以制造出IPSCs,而不會在細胞核中放置任何東西,這可能意味著這些干細胞具有更少的突變和整體更好的特性。”神經(jīng)科學

IPSCs可以由患者自己的細胞制成,并且在個性化細胞療法和器官再生中具有多種潛在用途。然而,IPSCs設想的臨床用途尚未實現(xiàn),部分原因在于制造它們所涉及的風險。

標準IPSC誘導程序,十年前開發(fā)并稱為OSKM,涉及將四種轉錄因子蛋白的基因插入成體細胞:Oct4,Sox2,Klf4和c-Myc。隨著這些基因的添加和活性,它們編碼的轉錄因子蛋白被產(chǎn)生,并進而重新編程細胞成為IPSCs。

該方法的一個問題是病毒插入事件或核重編程因子的過量產(chǎn)生可能以使細胞癌變的方式損傷細胞DNA。另一個原因是這種核重編程通常會產(chǎn)生一系列具有可變特性的IPSCs。“即使我們在實驗室中使用IPSCs來研究疾病,這種可變性也是一個問題,”Baldwin說。

相反,在普通動物發(fā)育過程中,細胞特性被來自細胞外部的分子信號改變并誘導基因活性的改變,而沒有任何有風險的DNA插入。為了找到這樣的自然途徑 - 普通細胞可以轉化為IPSCs-Baldwin和她的實驗室與Richard Lerner的TSRI實驗室,Lita Annenberg Hazen免疫化學教授合作。Lerner幫助開發(fā)和篩選大型人類抗體庫,以尋找新的抗體藥物和科學探針。

在這種情況下,該團隊,包括研究生Joel W. Blanchard和博士后研究員Jia Xie,他們是主要作者,建立了一個包含大約1億種不同抗體的文庫,并用它來尋找任何可以替代OSKM轉錄因子的抗體。

在初的一組實驗中,研究人員試圖找出可以替代Sox2和c-Myc的抗體。他們建立了大量的小鼠成纖維細胞 - 通常用于在實驗中制造IPSCs - 并插入其他兩種轉錄因子Oct4和Klf4的基因。接下來,他們將巨大的抗體基因庫添加到細胞群中,使得每個細胞終含有一種或多種抗體的基因。

然后,科學家們可以觀察到哪些細胞開始形成干細胞集落 - 表明這些細胞產(chǎn)生的一種抗體已經(jīng)成功地取代了Sox2和c-Myc的功能并觸發(fā)了細胞身份的轉換。對這些細胞的DNA進行測序使研究人員能夠確定負責的抗體。

通過這種方式,TSRI團隊發(fā)現(xiàn)了兩種可以替代Sox2和c-Myc的抗體,并且在一組類似的測試中,他們發(fā)現(xiàn)了兩種可以替代第三種轉錄因子Oct4的抗體??茖W家表明,他們可以簡單地將抗體提供給培養(yǎng)的成纖維細胞,而不是插入這些轉錄因子基因。

在這項初步研究中,科學家們無法找到替代第四種OSKM轉錄因子Klf4功能的抗體。然而,Baldwin預計,通過更廣泛的篩查,她和她的同事終也會找到Klf4的抗體替代品。“我認為那個會花費我們幾年時間來弄明白,”她說。

原則上,抗體篩選方法不僅可以讓科學家找到可以替代OSKM轉錄因子的抗體,而且還可以研究這些抗體起作用的天然信號通路。

在這個原理的證明中,科學家發(fā)現(xiàn)其中一個替代Sox2的抗體與細胞膜上的蛋白質Basp1結合。這種結合事件阻斷了Basp1的正?;顒?,從而消除了WT1的限制,WT1是一種在細胞核中起作用的轉錄因子蛋白。然后釋放WT1,然后改變多個基因的活性,終包括Sox2,以使用與使用原始重編程因子時不同的事件順序來促進干細胞狀態(tài)。

WT1(Wilms腫瘤1)在一些癌癥中過量產(chǎn)生并且被認為是致癌基因。這一事實凸顯了此類研究的附加價值:幫助科學家了解癌細胞發(fā)育與干細胞狀態(tài)之間的關系。

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